Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms