Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms