Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd1D3YXK1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms