Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms