Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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