Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Atp8b5A3FIN4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Atp8b5A3FIN4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Atp8b5A3FIN4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Atp8b5A3FIN4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Atp8b5A3FIN4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Atp8b5A3FIN4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Atp8b5A3FIN4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp8b5A3FIN4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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