Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms