Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd1A2AKB4 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms