Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Znf394Q9Z1D9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Znf394Q9Z1D9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf394Q9Z1D9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms