Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cldn9Q9Z0S7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cldn9Q9Z0S7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cldn9Q9Z0S7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cldn9Q9Z0S7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cldn9Q9Z0S7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cldn9Q9Z0S7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cldn9Q9Z0S7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cldn9Q9Z0S7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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