Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms