Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms