Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms