Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp1Q9QY53 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms