Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdc42ep4Q9JM96 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms