Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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