Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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