Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l2Q9JLG4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms