Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ldb3Q9JKS4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms