Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl28Q9JIL2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms