Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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