Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MesdQ9ERE7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms