Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clstn2Q9ER65 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms