Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms