Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl4Q9DCU6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl4Q9DCU6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms