Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hmg20aQ9DC33 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms