Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ftsj3Q9DBE9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms