Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smco2Q9DA21 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms