Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp12Q9D9M2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp12Q9D9M2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms