Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn23Q9D7D7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Cldn23Q9D7D7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Cldn23Q9D7D7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Cldn23Q9D7D7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Cldn23Q9D7D7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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