Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms