Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms