Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stag1Q9D3E6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms