Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp35Q9D384 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp35Q9D384 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp35Q9D384 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp35Q9D384 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp35Q9D384 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp35Q9D384 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp35Q9D384 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp35Q9D384 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp35Q9D384 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms