Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms