Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Mrpl28Q9D1B9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Mrpl28Q9D1B9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Mrpl28Q9D1B9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Mrpl28Q9D1B9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Mrpl28Q9D1B9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Mrpl28Q9D1B9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Mrpl28Q9D1B9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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