Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hddc3Q9D114 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hddc3Q9D114 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms