Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms