Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Shisa9Q9CZN4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms