Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms