Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CYI0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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