Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms