Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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