Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms