Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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NsmfQ99NF2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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NsmfQ99NF2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms