Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms