Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms