Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TriobpQ99KW3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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