Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp11Q99K46 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp11Q99K46 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms