Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlcd1Q99JT6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms